《黑客帝国》里母体的真相到底是什么？
什么内部试映？难道还有新的要出吗？
Matrix应该是相当于电脑主机阵列吧，虚拟世界的运行基础，可能类似操作系统和硬件一类的东西。
Matrix的本意是子宫、母体、孕育生命的地方，同时，在数学名词中，矩阵用来表示统计数据等方面的各种有关联的数据。这个定义很好地解释了Matrix代码制造世界的数学逻辑基础。在电影中，Matrix不仅是一个虚拟程序，也是一个实际存在的地方。在这里，人类的身体被放在一个盛满营养液的器皿中，身上插满了各种插头以接受电脑系统的感官刺激信号。人类就依靠这些信号，生活在一个完全虚拟的电脑幻景中。机器用这样的方式占领了人类的思维空间，用人类的身体作为电池以维持自己的运行。
在电影中，Matrix是一套复杂的模拟系统程序，它是由具有人工智能的机器建立的，模拟了人类以前的世界，用以控制人类。在Matrix中出现的人物，都可以看做是具有人类意识特征的程序。这些程序根据所附着的载体不同有三类：一类是附着在生物载体上的，就是在矩阵中生活的普通人；一类是附着在电脑芯片上的，就是具有人工智能的机器；这些载体通过硬件与Matrix连接。而另一类则是自由程序，它没有载体，诸如特工、先知、建筑师、梅罗文加、火车人等。
Matrix是一个巨大的网络，连接着无数人的意识，系统分配给他们不同的角色，就象电脑游戏中的角色扮演游戏一样，只是他们没有选择角色的权利和意识。人类通过这种联网的虚拟生活来维持自身的生存需要，但Matrix中的智能程序，也就是先知的角色，发现在系统中有1%的人由于自主意识过强，不能兼容系统分配的角色，如果对他们不进行控制就会导致系统的不稳定，进而导致系统崩溃。因此编写Matrix的智能程序，也就是建筑师就制造了“救世主”，让他有部分自主意识，并成为觉醒人类的领袖，带领他们建造了锡安。
在黑客帝国世界中为什么很多人说锡安也是虚拟世界，那究竟什么是真实世界呢？
以下是我看过黑客帝国系列第三遍后，去网上搜索到的解说，很详细，看完你就懂了，很佩服写这个的人，可以原作者不知道是谁，在此向TA致敬！
一开始，人类和机器大战，结果人类输了。但奇怪的是人类没有灭亡，而是变成了机器的能源。机器从人类身上获取能源显然是个假象，或者说，人类的确在做机器的电池，但这显然不是机器的目的，因为它们从人身上获取能源显然不如直接获取养活人类的那种能源来的划算。机器没有灭绝人类，可能有两个原因吧，一方面，一开始机器就有怜悯之心，它们不希望人类灭绝，但又不再想受人类威胁，最好的办法就是囚禁他们的身体，然后用一个虚拟世界来控制他们的精神，把人类作为生物电池只是副产品；另一方面，可能是机器希望研究人类以改善他们自己，同样出于消除人类威胁性的考虑，必须把人类以某种方式囚禁起来。我想对于Matrix的产生两个原因都有一点。总之，Matrix就这样诞生了。不管第一个Matrix是怎样的，总之它就是个真到让绝大多数人都以为是现实的虚拟世界，所有人的身体都在当电池，而他们的精神都活在Matrix中。Matrix的设计者就是那个设计师了，我认为他和第三集里的机械大帝是同一个东西，它就是机器世界的最高管理程序，机械大帝是它的载体，设计师是它在Matrix里人型化的投影。当然，也有可能设计师只是最高管理程序的子程序罢了，因为机器们可能有很多事情要管，不是只局限于Matrix。
一开始，这个设计师的脑袋似乎只有一根筋，它设计的Matrix里的所有东西都是可计算的，就是在数学上是完美的，人类也必须在这个完美的数学模型中运行，但显然人类不是这样，人类的怪点子太多了，所以第一代Matrix崩溃了。他不死心，还以为这是因为人类不适应新环境，所以又以人类历史为背景重写了Matrix，但这一代Matrix又失败了。最高管理程序（或者是设计师）于是只好又编了一个研究人类心理的超级程序—它就是先知。在她的提示下，设计师的脑筋开始有点会转弯了。他让matirx里的人类开始有选择，这样Matrix就更接近现实世界了，但是这个Matrix还是有问题，主要是两个：一是人类中总有1％的人不那么老实，他们总觉得Matrix不是真的，如果把他们闷坏了，Matrix还是会崩溃；一是由于Matrix系统的不断改进，一些旧的程序会不时被删除，但总有那么一些程序不想被删，它们就在Matrix里躲起来（那个法国人就是这类程序中的佼佼者），成为非法程序，这种程序总删不掉的话，Matrix也有崩溃的危险。为了解决这两个问题，设计师想到了一个一举两得的办法：一方面，他让那1％不太老实的人觉醒，从Matrix中脱离，让他们在现实世界的地底造一座叫zion的城市，成为Matrix的黑客，进行抵抗运动，实际上这是完全在设计师的控制之下的，这只是一种迂回的控制，因为如果把这些人强行压制在Matrix里反而对Matrix不利；另一方面，设计师集合他能找到的所有非法程序的原始代码（应该是原始代码，因为如果设计师直接知道非法程序的代码，那它直接删就行了）编写一个叫做“救世主”的程序（代码），这个程序显然可以发展成非法程序的最终形式，这个程序被植入Matrix的某个人类的精神中（到底怎么选中这么一个人的，电影里没说），那么这个人就成为救世主，之所以叫他救世主是因为它的一个作用就是它是那些zion中觉醒的人类的“救世主”，因为每到zion的力量强到开始对机器产生威胁时，黑客们就会遇到先知（这也是设计师的安排），先知会告诉他们寻找救世主，说救世主能帮助他们打败机器，救世主被找到后不久，也就正好是它的超能力觉醒的时候，这其实是他身上的那些非法程序的代码终于成熟了，这样，又在先知的指引下，黑客们和救世主来到Matrix的代码之源，救世主见到设计师，得知真相后，救世主不得不带着身上的非法程序代码、按设计师的吩咐返回代码之源，让Matrix的代码库升级，Matrix并在此基础上升级重载，重载后的Matrix就能对付原来那些非法程序了（救世主这一身份只不过是为他的归还代码找个理由罢了）。在救世主见设计师时，机器军队也在毁灭zion，救世主完成他的“升级代码库”的任务后还有一项任务就是从Matrix中选23个男男女女重建已毁灭的zion，当然，也许是几代之后，这23个人的后代们又会在先知的指引下去寻找新的救世主。可悲的是，救世主往往只能选这一条路，因为如果他不这么干，设计师就会毁灭全人类。这里顺便说一下，救世主到底是人还是程序？其实，Matrix里的程序和人的精神（灵魂）的差别已经很小了，像第三集的印度人都有了人类的爱情和亲情，他们的不同可能仅仅是载体不同而已，程序的载体是芯片，灵魂的载体是人脑。所以，程序和灵魂是可以结合的。救世主其实就是以人脑为载体的人本身的精神和“救世主代码”的结合体。精神和代码已经不分了。
以上是前几代救世主的命运，到了Matrix升级的循环到了第六代的时候，先知这个程序可能是研究人研究得深了，自己也变得人性化起来，逐渐变成了一个好人（正确的说是一个善良仁慈的程序），她开始收留一些非法程序，有的被她养着，有的成了她保镖，它还开始怜悯起那些觉醒的人类前赴后继但全不知情的抵抗和一次次被毁灭的结局。因此，先知开始有了一个计划，她要通过一个方法让Matrix的升级在这一代结束。她的计划包括两个方面：一方面，她要让这一代的救世主在见到设计师时不选择进入代码之源，她的方法是让设计师稍稍改变救世主的代码，让他爱上某一个黑客（当然这一意图是不能让设计师知道的，先知可能是告诉设计师她只是要做个小实验罢了，比如说观察加入爱情后救世主的反应，第二集里设计师自己也说：“观察你的反应是很有趣的”，先知料到设计师会低估爱情的力量，认为救世主还是会选择进入代码之源。所以我觉得neo爱上trinity是先知和设计师的安排，这虽然很可悲但却合理）这样救世主为了救心上人而放弃进入代码之源。第二集结束时，先知的这一步计划成功了，但仅有这一步是不够的，因为如果救世主不进入代码之源，那么设计师就会毁掉全人类，而且zion照样会被毁灭。所以另一方面，先知必须要给救世主准备一个可以和机器大帝（设计师）谈和的筹码，这个筹码就是smith。先知说了，Smith是救世主程序的反面，我认为这样的程序是不可能自己形成的，smith这一程序应该是先知一手改写的。按照设计师的说法，先知这一程序是要定期检查的，不然也会危及系统，这说明先知在Matrix中的能力（或者说权限）是相当大的，她极有可能用某些方法改写了smith的程序（连法国人和印度小女孩都能编写程序，何况是神通广大的先知呢？），而且是用救世主程序的反面改写的，所以smith还是个合法程序时，他就强烈表现出非法程序的“气质”（审问Morpheus那段，他想脱离Matrix的愿望比neo还强），而在救世主身上的非法程序代码苏醒（力量觉醒）之时，smith身上的非法代码也激活了。如果说救世主是设计师可控的非法程序最终形式的话，那么smith就是设计师意料之外的最可怕的非法程序。其实，smith是先知计划中很重要的一枚棋子，先知就是要让smith强大到设计师无能为力的地步，而只有neo可以凭借身体内与smith相反的代码将其中和，neo以消灭smith为条件换来和平。——以上就是先知的如意算盘了，这其中有一些过程先知可以凭借她在Matrix内的精密计算和她对人类心理的深刻理解而预知，还有一些也是听天由命的，正像最后设计师对先知说的：“你玩了一个很危险的游戏”。
先知基本上也就是赌一把。整个Matrix系列说的好像基本上就是先知这一人类拯救计划的执行过程。这一代的黑客代表人物Morpheus和Trinity等人找到了这一代的救世主载体Neo。Neo在历尽磨难后终于变成了救世主（其实是必然的），他同时也爱上了Trinity（其实先知早就告诉Trinity了，这根本就是先知安排的——我们经常说的“造化弄人”实际上是不是脑子里被写进了一个程序呢？）。（第一集）
Simith在被Neo干掉之后也顺理成章地成了非法程序，能力开始成长（复制能力）。然后neo他们又从非法程序的精神领袖那里抢来了知道如何进入代码之源的程序。从这个精神领袖的话中得知，似乎每一代救世主都要找他麻烦，似乎这也是设计师的安排。Morpheus他们在得到Neo后变得越来越神勇，原来见到Agent像耗子见了猫似的，但这时已经不怎么害怕了，还能和他们过几招。后来neo终于见到设计师，Trinity也“很及时地”遇到危险，得知救世主真相后的neo为了救心上人还是弃全人类不顾，毅然决然救了Trinity，回到现实。得知真相的Morpheus也备受打击，从此光采尽失。这时neo突然有了在现实中击毁电子章鱼的能力，当然，用了一次就晕了。（第二集）
这时，有复制能力的smith居然复制到了一个zion的人类身上还把人类的飞船都破坏了。这些飞船上有人类最厉害的武器（那种按一下机器人就死光光的东西，忘了叫什么了）。这时只剩下配合neo他们行动的两艘飞船了。一艘返回zion去支援那里只用非常简陋的机器人和电子章鱼拼命的人类军队。另一艘载着neo和Trinity去机器城见机器的老大——机器大帝。途中遭被smith复制的那个人的突袭，neo双眼被刺瞎，但他在现实中感知和摧毁代码的能力却完全觉醒了，其实这是因为在第二集结束时，neo接触了Matrix的最高管理程序——设计师而成长了，他原来只能在Matrix中感知代码，现在由于学习，他也能在现实中感知代码了，原来必须接触Matrix，现在可以远程感知了（所以neo在现实中有超能力根本不是说zion也是虚拟世界，只不过是neo的能力从插卡式进化到遥控式罢了，他在现实中的超能力还是仅限于代码的）。他们干掉了这个smith，终于闯进了机器城，但Trinity牺牲了。这时，Matrix中的smith果然已经如先知预期的那样几乎把整个Matrix里的人和程序都复制成他自己了，包括先知自己在内（至于为什么smith吸收了先知之后还是不知道这是先知的计划，这可能是因为先知这个程序即使被吸收也还是有保护代码，smith无法完全破解——只能这样理解了，不然我的文章就白写了）。Neo和机器大帝达成协议，进入Matrix消灭Smith，换取人类和机器的和平，机器大帝同意了。结果Neo和Smith在无数Smith的注目下决战，Neo当然打不过Smith了，但是最后Smith同化Neo时，Neo释放自己的代码，和Smith同归于尽了。这时，所有被smith同化的人都恢复原状，而和Neo的决斗的那个Smith恢复成了先知（这很容易理解，因为吸收了先知的smith显然是所有smith中最强的，所以代表无数smith和neo决斗的就是先知同化成的smith，从躺在地上的先知嘴角含笑来看，先知在被smith吸收后应该是还有自我意识的，她知道自己的计划终于实现了）。这时，进攻zion的机器大军也撤退了。第二天，先知和设计师碰面，设计师承诺遵守诺言，不再迫害那些觉醒的人类，从此人类可以在Matrix和zion之间自由选择。Matrix里第一次升起了不带绿色的朝阳，地球成了一个人类和机器、机器城和zion、觉醒的人类和Matrix中的人类、合法程序和非法程序共存的和谐世界。革命成功了！（第三集）
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《黑客帝国》表达了怎样的哲学思想？
黑客帝国这部电影基本接近了世界的真相。物质世界并非真实存在，只是众生灵性最深处的业力的幻化成像。由众生的意根攀缘而入此四大聚合的身体，因此感知世界的存在。犹如缸中之脑。宇宙是有生命的。他的创造力来自众生的妄想执着。在这个宇宙幻境中，每个人都是主角，都是世界大戏法的创造者和扮演者。在宇宙的最深处，有一个储存每个众生创造的脚本数据的“真如性海”。每个众生的意根具有随时上传和下载数据的功能，而且是凡夫无法觉察的高速带宽。每个人的命运都是在意根下载的业习中完成。要想改变命运，只有终止意根的下载功能，或者加强自主的定力，不被意根下载的业习影响自己的决策。说到底，就是降服自己的意根。至于降服之后如何全部掌控真如性海的一切数据和使用方法，那就需要进一步觉悟了。
《黑客帝国》是如何揭开新世界？
《黑客帝国》第一代的Matrix，是一个完美的乐园，如同希腊神话中的黄金时代，
或者圣经中的伊甸园。然而这个世界实在太过于幸福了，以至于所有人都
察觉这是一场梦幻——这导致了系统崩溃。
从第二代开始，Matrix被设计成模拟人类21世纪的历史，也就是
你我眼前的现状。
黑客帝国讲的是什么故事？
..其实呢,在黑客帝国里的全部三部电影中都没有真正涉及到真实世界,里面没有任何一环节透露了虚拟世界之外的真实世界..这部片子我连续看了不少遍,再网上又看了一些比较靠谱的评论,所以基本上对这部电影来说是算看透了.看这部片子,首先必须要掌握关于系统与程序的基本知识,这样看起来就会容易懂很多,同时还要带一些宗教色彩..因为这部片里,Neo不仅演绎着"系统里的超级杀毒软件",还赋予了Neo一个救世主的身份,也就是所谓的耶稣.不过他只是"系统"内的"耶稣"而已..整个片子我给你大概叙述一下,可能你就能懂了:故事发生在虚拟世界的21世纪中,在墨菲斯(就是那个大只佬黑人)所谓的真实世界中,他找到了救世主Neo,并把他从21世纪的虚拟世界带回到他所认为的现实世界,墨菲斯所认为的现实世界就是机器人所执掌的天下,部分纯种人类生活在地下的锡安城市中.而机器人不断进攻锡安人,而锡安的人们便发起反抗.墨菲斯得到了先知的指点,把救世主Neo带回拯救他们.这里又说到那个带墨镜的斯密斯,他原本只是21实际虚拟世界中的特警,也是就是杀毒软件,杀掉一切异常的程序.Neo在21世纪虚拟中就属于异端程序,斯密斯有理由把他干掉.但是第一部最后斯密斯把他干掉后而Neo又活过来反而把斯密斯干掉,这违反了系统的理论,所以系统又无法删除非逻辑下斯密斯,这才让了斯密斯在第二第三部脱离母体控制升级为了超级病毒.有点必须指出.锡安绝对不是什么真实世界..看一下第二集中那个守护天使的出现,当时neo看他的时候,周围都是绿色程序代码,而天使是金黄色的,这说明他是个更高级的程序.而在第三集中,Neo仅仅凭自己的念力就击退了乌贼,恐怕这在现实世界中是不可能的.当他双目失明的时候,看到机器城也全都是金黄色的代码组成.并且斯密斯仅仅是个程序而已,又怎么能在所谓的真实世界里把班尼(就是那个把Neo弄瞎的)复制为自己呢?这说明包括Neo和锡安城在内的所有人以及Neo去的机器城,很显而易见都是另一个虚拟世界.其实墨菲斯那帮人,就是一些处于机器世界里一些总是不甘心自己命运的程序而已,总想弄一些反抗.而造物主为了让系统平衡,便创造了机器城这个虚拟的世界,人类把机器所需求的太阳能来源给切断了,机器便培育人类来当他们的电池,于是你看到了一个看不见阳光并由机器统治的世界~那么机器进攻而系统就让墨菲斯反抗.在第二部里系统建筑师就说的很清楚了,锡安也是系统的一个副本程序而已,在第6代救世主之前,锡安已经重组5次了.而第六次重组就是第三部的体现,机器进攻并摧毁锡安,然后系统带7男16女去重启.这样才能让系统维持平衡.不过第六代救世主Neo与之前5代不同,他赋予了爱.所以做出了些前五代救世主不同的选择.反正最后,Neo为了还机器世界里的和平,用自己与斯密斯相抵消的条件与机器之王达成协议,当斯密斯入侵Neo身体时,机器之王便得到了斯密斯的代码,于是把neo和斯密斯都抵消了.
呵呵,说的好像有些繁琐了..总之,黑客帝国里没有真实世界,neo和所有人都只是一个程序而已,所有好的坏的程序都只是系统为了达成平衡而已.或许会出第四部,或许不会..第三部的最后,先知问建筑者机器城里的人类怎么处理,建筑者说他当然会去释放..但这又怎么可能长久呢,人类是机器所依赖的能量来源,释放了之后机器靠什么存活?机器不能存活的话,这个世界的系统又怎样能维持平衡呢?
纯属原创.打字辛苦,望采纳..
黑客帝国1，2，3讲的是什么？
黑客帝国1，2，3讲的是；《黑客帝国》讲述一名年轻的网络黑客尼奥发现看似正常的现实世界实际上是由一个名为“矩阵”的计算机人工智能系统控制的。尼奥在一名神秘女郎崔妮蒂的引导下见到了黑客组织的首领墨菲斯，三人走上了抗争矩阵的征途。
8分钟看完《黑客帝国》，这个世界是真实的吗
早在黑客帝国之前就已经有很多学者提过相应的假说和理论，其中非常著名的就是‘缸中之脑’和‘感知世界’。前者提出的假说设定人脑通过电极传导的技术获得对外界的感知，那么缸中的大脑是否知道自己身处缸中呢？（这是十大思想谜题之一，更接近于一个悖论）后者是有梅洛提出的知觉现象学，我们所定义的世界都是我们通过自己的接触来感受到的，他以左右手互相接触举出了一个例子---这两只手同时触碰对方，并且这两种感觉无法分开---所以感觉和身体是共同体。在我们对这个世界定义之前，这个世界就已经存在了，而我们所定义的世界，不过是我们自己创造出来的复杂的概念。个人认为黑客帝国倒是更偏向于探讨在未来世界，人在人工智能的大环境中，该如何被重新定义。黑客帝国更像是一个警示以及探索，本意不是将观众引向‘世界是否存在’这样的问题，毕竟这种讨论无解且概念性太重。最近的生物中心论主张时间和生死也是人自己定义的，在某一种角度来说人甚至可以永生也是这种悖论的调调。
黑客帝国4讲的是什么故事
看完黑客帝国4，第一感受的确不是很好，但还是会有一种意犹未尽的感觉。
毕竟和前3部的上映已经间隔了太长时间，剧情的衔接难免会有一些断层。这篇文章的回答主要分为2个部分：
1、黑客帝国4剧情主线解析梳理；
2、黑4中部分剧情问题解析；
（1）矩阵还存在吗？为什么矩阵还会继续存在？机器反悔了？
（2）年轻版的墨菲斯从哪来的？
（3）为什么矩阵中的场景会实时反映在尼奥制作的游戏中？
（4）为什么一直找不到尼奥，花了60年？
（5）为什么史密斯可以无视分析师的时间静止能力？
（6）为什么许多程序没在版本迭代中被清理掉？
（7）为什么尼奥很年轻？
引言：黑客帝国的本质就不是商业片，而是包裹了一层商业皮的文艺电影。它的科幻感更多是一种包装，来为沃卓斯基姐妹的世界观保驾护航。
时隔20年的重启，这20年间信息技术发生了革命性的变化，而人类社会因此而生出更多的选择和想法，也与1999年完全不同。这种变化改变了导演，而她真实的想法在这一部中自由地体现了出来。人类靠爱来维系，靠理解来发展进步。一成不变，守旧封建的思想禁锢向前的脚步，所以过去的Zion只能成为历史，执着于曾经传说的墨菲斯也终究成为了过去。
黑客帝国的核心元素从来就不应该是墨镜和黑风衣，还有炫酷的动作设计，这些是附加的漂亮外衣，它内体，如同被粘稠的培养液浸泡着的漂亮躯体，以及所有awake people，他们的选择。从来没有选择，所有的选择都是你以为你有选择，而你早就已经做出了选择，而你需要做的是理解你的选择。这种使命感和归宿感在这一部更为明显得表现出来。崔妮蒂一定会选择相信尼奥，尼奥一定会选择拯救唤醒崔妮蒂。
在影片的中后段，大反派“分析师”（the analyst）终于说出系统复活尼奥与崔妮蒂的目的——用爱发电。两人当年的行动多么轰轰烈烈，对系统造成了不小的伤害，但系统可以反过来利用这种能量。他们把尼奥和崔妮蒂（蒂芙尼）设计成互相倾慕而不可得的关系，让两人之间“爱”的能量永远处于满值却又不溢出（对系统造成危险）的状态、做矩阵的情感劳工——两人如同视频网站上做夸张反应的up主或为女主播刷火箭的观众，连结似有若无，不断生产并维持着能量供系统去驱使利用。
人类和机械，究竟差距在哪呢？人类的智慧创造出了机械，催生出来了人工智能，甚至能够让机器学会思考。机械能够在物理意义上远超过人类，一旦其不再为人类而服务，人类将陷于低生活被反过来奴役的境地，能够拿出来与之决斗的砝码，便只有情感、信仰、希望。这是人类区别于机械的最高级的存在。机械不会有感情，不会相信奇迹，不会有希望，不会有强大的意志力，100%的理性，而进步的变革需要不理智的火花去点燃进程。
1、黑客帝国4剧情主线解析梳理：
首先我们回顾一下黑3的剧情，在黑3中，机器大军最终定位了人类最后的城市“Zion”，并派遣机器大军攻城，具备“自由意志”的人类(Human)与机械大军（the Machine）在锡安（Zion）发生激烈战争。
由于战力相差悬殊，眼看人类就要灭族，救世主尼奥（the One）以彻底清除史密斯变异病毒为条件，要求机器大军撤军，与人类维持和平。尼奥自认为最终与机械达成共识，在母体内部与史密斯发生激烈战斗。
最终尼奥选择了自我牺牲，清除了病毒史密斯，同时，机器大军撤军，锡安得以保留，矩阵承诺带给所有人真相（主要指仍然在矩阵中的未觉醒的人类），母体迎来了耀眼的日出。（注意，在这个过程中，尼奥的爱人崔妮蒂也阵亡了。）
黑4的剧情发生在黑3事件60年之后，时间来到23世纪下半。
黑4开头，还是熟悉的音乐，熟悉的配方
这里很明显是在致敬黑1，崔妮蒂和墨菲斯说过同样的话“You were right”,画面也似曾相识
影片开始，一个黑夜，一名黑衣人像崔妮蒂一样被追杀。
不同的是，更多的黑衣人出现，最终抓住了假崔妮蒂，引来了巴戈斯（Bugs）。（没错，他的名字就叫BUGS，不言而喻。）
一群黑衣特工对巴格斯紧追不舍，
巴格斯逃到一个布满钥匙的房间，这里也是暗示这个房间会有些奇怪的后门。
果然，关键时刻，神秘黑衣特工开后门解救了巴格斯。
这里又是一大段对白以及截图，从这里我们能了解到非常多事。
墨菲斯没死，变成了程序得以保存，而且还通过某种方式覆盖到一个特工程序身上，导致一个特工叛变，这个叛变特工名字叫史密斯。
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（这个黑人小哥亲口承认自己是墨菲斯，再次开始寻找尼奥，外形更加年轻强壮，但是和墨菲斯有几分相似，可以猜测就是年轻状态的墨菲斯，请忽略战五渣翻译）
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可以对比下，外形确实很相似。
（2）尼奥没死
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巴格斯第一眼看到的外形其实并不是尼奥，而是另一个人，暗示尼奥的外形发生了变化，应该是被重新编程了，但是巴格斯说他擅长监听，虽然尼奥此时没有觉醒，仍然受到了救世主的影响发生觉醒。
黑衣特工在巴格斯的劝说下，吃下红色药丸，成为墨菲斯，肉体以拟态的方式存在于现实中。
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最后两人开启水面通道，成功摆脱特工追杀。
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镜头切换，一个长相酷似尼奥的人（姑且继续称他是安德森）在做游戏开发，（似乎还是个VR游戏。）
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可以看到他开发的游戏就是黑客帝国，而且还得了很多奖，游戏最早发布时间就是1999年。
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这时游戏系统忽然出现了BUG,出现BUG的地点刚好就是刚才巴格斯救墨菲斯的地方。这里我们很容易联想到刚才发生的一切是不是只是游戏场景。
之后安德森和同事裘德一起喝咖啡闲聊（这人叫JUDE,和犹大同名，暗示不是啥好货），碰到一个酷似崔妮蒂的人上前搭讪，得知对方叫蒂芙尼，已婚带俩娃，老公叫查得。
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聊完回办公室发现，刚才出BUG的模块消失且被清理。
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之后安德森被老板叫去办公室，聊到第一次见面有种被FBI审讯的感觉，加上闪回，可以推断这个老板就是史密斯。
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这里还同时调侃拍黑4就是因为市场难做，为了骗钱，不管有没有之前的演员都非拍不可- -
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聊完安德森觉得又分不清现实和虚拟世界的边界了，于是去找心理咨询。（这心理咨询师的眼镜都是蓝色的，和蓝色药丸颜色一致，暗示心理咨询师是矩阵系统的组成部分）
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心理咨询师给安德森开了一大瓶蓝色小药丸，嘱咐药不能停。安德森吃了药之后就开始继续无聊的游戏开发生活。
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这句话的大概意思是“埋葬现实比处置梦想要简单的多”
随着游戏开发的深入，安德森对世界越发感到怀疑，开始停药，同时在咖啡馆多次偶遇蒂芙尼。
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大楼偶发事故，让安德森碰到了墨菲斯，安德森对墨菲斯的长相大为震惊，因为和他游戏里编辑的人物长相完全一致。
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大量警察到来，打断了他们的谈话，火拼在所难免。
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换皮史密斯出现，带着标志性动作成功追杀安德森，安德森被系统重置，安插了一段其他的记忆。
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安德森大脑彻底被搞残，在准备尝试飞行（跳楼）之前被赶来的巴格斯救下。
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终于成功救出安德森，安德森再次成为尼奥。
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苏醒后的尼奥发现崔妮蒂没死，而且就在他的培养皿旁边。
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巴格斯带着尼奥回到人类城市IO，见到了老朋友奈奥比
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奈奥比告诉尼奥，黑3之后，大量人类觉醒，机器能源不足，部分机器人觉醒自由意识，内部发生战争。
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同时，墨菲斯高票当选理事会主席，拒绝和机器人建立任何合作，一部分人类认识到仅仅依靠现存力量永远无法打败机器，所以离开了ZION，重新建立了新的城市IO。
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尼奥恳求奈奥比帮助营救崔妮蒂遭到拒绝，于是偷偷和巴格斯联系准备自己去救。
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再次进入矩阵的尼奥刚走两步就遇到了换皮史密斯
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通过对话得知，尼奥的心理医生就是新任矩阵管理员，而史密斯还是想伺机报复矩阵
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史密斯找来一群老熟人，冲突在所难免。这个老熟人就是黑3中搞色情派对的古老程序法国佬
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只不过这货现在衣衫褴褛，似乎穿着他的下属火车人的衣服，或许也就是通过这种方式躲过了系统的清除？
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尼奥一个气功波让史密斯领了便当，其他喽啰应声而退。
终于，尼奥找到了崔妮蒂，但是分析师也同时赶到。
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现在的矩阵有了更可怕的控制力，可以让时间短暂倒退以及静止。
原来当年在尼奥消灭了史密斯之后，矩阵为了研究尼奥和崔妮蒂，治疗好了崔妮蒂和尼奥的伤势，并进行各种折磨。
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后来发现，只有将两个人放在一起，但是又不能相认，这样周而复始就催生欲望和恐惧，这就是人类的本性，就是现实世界最本质的特点，引入这样的机制甚至能推动矩阵完美运行。
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这里还能看到，这个分析师已经不是之前的分析师了。前任被他推翻并干掉了。
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并且这个分析师喜欢使用“集群模式”来维护矩阵稳定，集群和特工是同时存在的，可以看到，集群就是非常多的机器人角色，可以理解为矩阵中的披着人皮的AI,这种人战斗力虽然不强，但是人数众多。
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通过这样的方式促使矩阵完美的运行了很多年，发电量比之前还要高出很多，在培养皿中的人类几乎都不怎么捣乱了，用分析师的说法就是“比猪都快乐”
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简而言之，尼奥和崔妮蒂两个人在一起才能更好的发电并控制人类，如果尼奥不乖乖自己回培养皿，分析师就杀掉崔妮蒂。
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尼奥只能先乖乖的先撤回IO。这时，机器盟友找到了尼奥。
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原来，机器盟友的首领就是先知和上一任总工程师的女儿，她的父母都被现任分析师杀掉了，所以和现任分析师结下了梁子。于是她提出了营救计划，协助一起营救崔妮蒂。
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尼奥再次回到矩阵，恢复了崔妮蒂的记忆。分析师使用时间静止能力打算杀掉所有人
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关键时刻史密斯来找分析师寻仇，一顿操作猛如虎打残了分析师，崔妮蒂成功被救走。
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逃跑的路上遇到大量集群，关键时刻崔妮蒂觉醒了飞行能力救出所有人，全片结束
2、黑4中部分剧情和前作的关联，以及问题解析；
（1）矩阵还存在吗？为什么机器人反悔？
还存在，但已经不是之前的矩阵了。很明显总工程师承诺给人类自由，停止战争，导致机器世界资源紧缺，一部分人心生不满，篡位夺权引发战争，总工程师被杀，矩阵再次运行，而且发电量更大，控制了更多的人类。但是机器世界也发生了分裂，一部分机器和人类结盟。
（2）年轻版的墨菲斯从哪来的？
通过墨菲斯和巴格斯的对话可得知，矩阵应该是通过某种方式保存了老墨菲斯的部分意识，通过清洗利用改造成了特工（矩阵经常干这种事，所以这个猜测很合理），结果很墨菲斯自然觉醒，开始继续一边假扮特工一边寻找尼奥。
（3）为什么矩阵中的场景会实时反映在尼奥制作的游戏中？
我们可以看到，影片开头巴格斯救墨菲斯的地方，和黑客帝国游戏出BUG的地方是一致的。
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而尼奥第一次见墨菲斯的时候大为震惊，因为和他游戏中的角色形象完全一致，这就代表游戏中发生的事情很可能在现实中也发生过。
其实是巴格斯黑了安德森的系统，将这段剧情加入到了安德森的游戏里面，用来告诉安德森实际已经发生的事情。
（4）为什么一直找不到尼奥，花了60年？
因为尼奥在黑客帝国里的映射形象一直在发生变化，包括容貌声音等等，而且这种变化是彻底的，周围人自然的态度会帮助映衬这种变化，所以导致人类很难准确定位尼奥。
（5）为什么史密斯可以无视分析师的时间静止能力？
这里史密斯自己的解释是：“一但尼奥离开了矩阵，我就自由了。”我的理解是史密斯和尼奥类似于杀毒软件和病毒的关系，而且都版本更新很多代，一但尼奥不受矩阵控制，史密斯就可以绕过任何防御程序对其他程序进行感染。
（6）为什么很多程序没有在版本迭代中被清理掉？
首先不要小瞧矩阵的自我净化能力，先知和总工程师这样的人物都可以被清理。
其次，要对机器世界有深刻的理解，机器世界已经进化到每个机器也有自由的思想和意识，每个机器的想法并不都是一样的。
另外，有些程序没有被清理不是系统不想清理，而是很难清理，参考史密斯，可以随便换皮，程序太多了，系统很难定位
最后，有些程序不清理是因为核心代码有用，比如墨菲斯，可以当特工，程序重新写一下就能用。
（7）为什么尼奥很年轻？
因为时间流逝在矩阵里和现实中是不一样的，身体一直泡在那个新发明的培养仓中可以活的更长久。